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病毒來自科研機構泄漏?石正麗:用生命擔保與實驗室無關
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2020-02-03 01:27 來源:僑報網綜合 編輯:羽堯

僑報網綜合訊】北京時間2月2日下午,中國科學院武漢病毒所研究員石正麗在朋友圈說:“2019新型冠狀病毒是大自然給人類不文明生活習慣的懲罰,我石正麗用我的生命擔保,和實驗室沒有關系。”此前,網上不斷有流言把此次疫情的發生與中國科研機構的實驗室病毒標本泄漏關聯在一起。

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石正麗。(圖片來源:中國科學院武漢病毒所官網)

中國科學報社旗下科學網官網微信公眾號報道,2月2日,印度研究人員于1月31日發表在bioRxiv上的有關新型冠狀病毒來源于實驗室的論文撤稿。

1月31日,《科學》也發布最新調查報道稱,生物信息學家正努力用科學擊敗“陰謀論”。

作為石正麗的長期合作伙伴,美國非盈利組織環保生態健康聯盟疾病生態學家Peter Daszak在接受《科學》采訪時表示,每當新疾病、新病毒出現時,都會產生諸如實驗室泄漏或者生物工程制造一類的“陰謀論”。“這令人羞恥!”

中山大學醫學院院長郭德銀也對《中國科學報》表示:“陰謀論從來不需要提供證據,但科學需要。”目前,基于基因組序列對病毒在進化上的分析結果,為證明病毒來源于自然界提供了強有力的證據,足以擊破人工合成的流言。

印度學者的論文說了什么?

微信公眾號“小柯生命”梳理了印度學者論文的內容。(“小柯”是一個科學新聞寫作機器人,由中國科學報社聯合北大團隊研發而成。)

1月31日,印度理工學院9名研究人員在預印本網站bioRxiv發表論文,聲稱在2019-nCoV突刺蛋白中發現了4個插入物與艾滋病病毒-1 gp120和Gag高度相似。

論文主要內容(注意:預印本網站bioRxiv的所有論文未經同行評議):

在2019- nCoV突刺蛋白中發現了4個插入物,它們是2019-nCoV獨有的,在其他冠狀病毒中不存在。

重要的是,所有4個插入物中的氨基酸殘基都與艾滋病病毒HIV-1 gp120或HIV-1 Gag中的氨基酸殘基相同或相似。

而且,盡管插入物在主要氨基酸序列上不連續,但2019-nCoV的3D建模表明,它們會聚構成受體結合位點。

論文作者認為,在2019-nCoV中發現4個獨特的插入物,都與HIV-1關鍵結構蛋白中的氨基酸殘基具有同一性/相似性,在本質上不太可能是偶然的。

這篇論文遭到學術界強烈質疑,論文作者被認為“夸大和扭曲了事實”。

有研究人員重新進行了原始序列比對,發現其中兩個被認為與HIV中gp120一致的序列在大量其他物種中也有發現吻合度達到100%的相同序列。而另外兩個被認為與HIV中gp120/Gag完全一致的序列則是通過人為加入許多氨基酸后的結果。

面對各方質疑,論文第一作者Prashant Pradhan在論文評論頁面聲明撤回論文,并表示課題組沒有制造陰謀論的意圖,感謝各方批評,將對論文進行修改。

病毒一次性進入人體,然后進行人際傳播

那么,新型冠狀病毒到底是從哪里來的?

中國科學報社旗下科學網官網微信公眾號報道,1月11日,由復旦大學上海公共衛生臨床中心暨公共衛生學院張永振教授領導的團隊在virologic.org網站發布了第一個新型冠狀病毒基因序列。第二天,另外5個來自不同患者的病毒基因組序列由中國國家衛健委領導的小組在全球共享流感病毒數據庫GISAID發布。

隨后,全球科研人員陸續公開分享更多患者的病毒基因組全序列,目前已有53例患者的病毒基因組全序列被共享在GISAID。

中國一位病毒學專家告訴《中國科學報》:“這些病毒序列應用現代測序技術,從患者血清中就可以提取。”

研究人員正在對這些病毒基因序列進行深入研究,試圖了解新型冠狀病毒的起源,以及它與在蝙蝠等其他動物中發現的病毒的進化關系。

華盛頓大學生物信息學專家Trevor Bedford告訴《科學》:“從病毒序列中得到的最重要的信息之一,是病毒一次性進入人體,然后進行人際傳播。”

對此,前述中國病毒學家解釋:“這意味著,目前正在傳播中的病毒來源于同一個‘祖先’,傳播路徑可能是病毒從動物偶然傳染給某一個特定的人,發生了變異,然后開始人際傳播。所以,如果能找到最早發生感染的‘零號病人’,病毒源頭就找到了。”

據《科學》報道,一個可能的解釋是,近期有一批動物被感染,通過感染某一個商販把病毒帶到人類身上。

從蝙蝠到人之間還存在1個或多個中間宿主

基因組序列顯示,此次流行的新型冠狀病毒nCoV-2019共有2.9萬多個核苷酸堿基。研究人員將它與已知冠狀病毒家族其他成員進行了比較,發現其與蝙蝠來源的冠狀病毒關系最密切。

1月23日,中國科學院武漢病毒所研究員石正麗帶領的團隊在bioRxiv發表文章指出,與此前在云南中菊頭蝠上檢測到的蝙蝠冠狀病毒RaTG13相比較,nCoV-2019在整個基因組中與其有96.2%的一致性,與非典(SARS)冠狀病毒有79.5%的一致性。

不過,Bedford分析,石正麗團隊提出的RaTG13序列與nCoV-2019有近1100個核苷酸的差異。他結合其他冠狀病毒的假定突變率估計,這兩種病毒在25到65年前有一個共同的祖先,RaTG13病毒突變為nCoV-2019可能需要幾十年的時間。

專家們的共識是,1100個核苷酸的差異意味著,nCoV-2019從蝙蝠到人之間還存在1個或多個中間宿主。

例如,非典病毒起源雖然起源于蝙蝠,但果子貍冠狀病毒與人類非典病毒之間的差異只有10個核苷酸左右。所以,這就可以推斷,果子貍是非典病毒的中間宿主。

“進化樹”分析帶來另一個好消息是,目前為止分析的不同nCoV-2019序列之間最多只有7個核苷酸的差異。這不僅表明它是最近才一次性進入人類體內的,更表明它尚未發生明顯的變異。

不過,在其傳播過程中,科研人員仍然沒有掌握武漢華南海鮮市場發揮的作用,只能確定其在早期疫情中“推波助瀾”。

“對于nCoV-2019從自然界中的某種宿主到中間宿主再到人,科學雖然難以以一種重現的方式去證明,卻可以用確鑿的證據,以完備的邏輯形成證據鏈,去確證結果。”郭德銀最后強調。(完)

編輯:羽堯
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